Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox6P40645 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox6P40645 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms