Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TfamP40630 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TfamP40630 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TfamP40630 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TfamP40630 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TfamP40630 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TfamP40630 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TfamP40630 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TfamP40630 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TfamP40630 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms