Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ThpoP40226 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms