Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd1P40201 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd1P40201 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd1P40201 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd1P40201 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chd1P40201 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chd1P40201 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms