Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms