Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn1P35821 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptpn1P35821 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptpn1P35821 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms