Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6fP35460 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms