Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola1P33609 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pola1P33609 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms