Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nedd1P33215 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms