Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpbP27048 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SnrpbP27048 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpbP27048 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpbP27048 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpbP27048 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpbP27048 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpbP27048 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpbP27048 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpbP27048 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpbP27048 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpbP27048 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpbP27048 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpbP27048 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpbP27048 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpbP27048 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpbP27048 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpbP27048 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpbP27048 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpbP27048 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpbP27048 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpbP27048 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpbP27048 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpbP27048 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpbP27048 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpbP27048 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpbP27048 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpbP27048 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpbP27048 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms