Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdgfraP26618 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdgfraP26618 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms