Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdk11bP24788 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk11bP24788 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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