Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd247P24161 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd247P24161 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms