Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk1P22518 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk1P22518 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clk1P22518 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk1P22518 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms