Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ms4a2P20490 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms