Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VimP20152 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VimP20152 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VimP20152 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VimP20152 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VimP20152 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VimP20152 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VimP20152 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VimP20152 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VimP20152 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VimP20152 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VimP20152 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VimP20152 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VimP20152 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VimP20152 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VimP20152 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VimP20152 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms