Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NefhP19246 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NefhP19246 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NefhP19246 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NefhP19246 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NefhP19246 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NefhP19246 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NefhP19246 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NefhP19246 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms