Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifrd1P19182 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms