Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps6ka1P18653 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps6ka1P18653 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms