Protein–RNA interactions for Protein: P16675

Ctsa, Lysosomal protective protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsaP16675 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsaP16675 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsaP16675 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsaP16675 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsaP16675 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsaP16675 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsaP16675 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsaP16675 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms