Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ass1P16460 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ass1P16460 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms