Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkceP16054 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkceP16054 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkceP16054 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkceP16054 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms