Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnmt1P13864 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnmt1P13864 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms