Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OtcP11725 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OtcP11725 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OtcP11725 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OtcP11725 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OtcP11725 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OtcP11725 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms