Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl2P10148 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccl2P10148 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms