Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CatspereP0DP43 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CatspereP0DP43 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms