Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnmt3cP0DOY1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms