Protein–RNA interactions for Protein: P0DM40

Fer1l5, Fer-1-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 2,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fer1l5P0DM40 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fer1l5P0DM40 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fer1l5P0DM40 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms