Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa6P09092 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa6P09092 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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