Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb1P09055 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb1P09055 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms