Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spta1P08032 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Spta1P08032 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms