Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P04213 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04213 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04213 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04213 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04213 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04213 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms