Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01808 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01808 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01808 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01808 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01808 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01808 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01808 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01808 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01808 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01808 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01808 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01808 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01808 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01808 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01808 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01808 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01808 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01808 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01808 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01808 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms