Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01746 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01746 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01746 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01746 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01746 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms