Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01668 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01668 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01668 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01668 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01668 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01668 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01668 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms