Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01664 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01664 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01664 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01664 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01664 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01664 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01664 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
P01664 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01664 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms