Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01663 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01663 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01663 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01663 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01663 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01663 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01663 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01663 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01663 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01663 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01663 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01663 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01663 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01663 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01663 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01663 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01663 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01663 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01663 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01663 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01663 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms