Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01662 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01662 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01662 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01662 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01662 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01662 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01662 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01662 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01662 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01662 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01662 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01662 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01662 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01662 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms