Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01646 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01646 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01646 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01646 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01646 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01646 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
P01646 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01646 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01646 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01646 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01646 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01646 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01646 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01646 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01646 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01646 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01646 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms