Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01645 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01645 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01645 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01645 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01645 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01645 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
P01645 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01645 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01645 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01645 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01645 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01645 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01645 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01645 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01645 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01645 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01645 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01645 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms