Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01638 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01638 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01638 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01638 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01638 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01638 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01638 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01638 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01638 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01638 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01638 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01638 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms