Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CpdO89001 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CpdO89001 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CpdO89001 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CpdO89001 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CpdO89001 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CpdO89001 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CpdO89001 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CpdO89001 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CpdO89001 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CpdO89001 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CpdO89001 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CpdO89001 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CpdO89001 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CpdO89001 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CpdO89001 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CpdO89001 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CpdO89001 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CpdO89001 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CpdO89001 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CpdO89001 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CpdO89001 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CpdO89001 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CpdO89001 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CpdO89001 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CpdO89001 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CpdO89001 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CpdO89001 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CpdO89001 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CpdO89001 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CpdO89001 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CpdO89001 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CpdO89001 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CpdO89001 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CpdO89001 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CpdO89001 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CpdO89001 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CpdO89001 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CpdO89001 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CpdO89001 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CpdO89001 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CpdO89001 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CpdO89001 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CpdO89001 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CpdO89001 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CpdO89001 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CpdO89001 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CpdO89001 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CpdO89001 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CpdO89001 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CpdO89001 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CpdO89001 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CpdO89001 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CpdO89001 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms