Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BlmO88700 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BlmO88700 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BlmO88700 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BlmO88700 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BlmO88700 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BlmO88700 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BlmO88700 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BlmO88700 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BlmO88700 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BlmO88700 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BlmO88700 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BlmO88700 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BlmO88700 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BlmO88700 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BlmO88700 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BlmO88700 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BlmO88700 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BlmO88700 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BlmO88700 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BlmO88700 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BlmO88700 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BlmO88700 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BlmO88700 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BlmO88700 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BlmO88700 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BlmO88700 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BlmO88700 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BlmO88700 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BlmO88700 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BlmO88700 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BlmO88700 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BlmO88700 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BlmO88700 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BlmO88700 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BlmO88700 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BlmO88700 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BlmO88700 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BlmO88700 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BlmO88700 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BlmO88700 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BlmO88700 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BlmO88700 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BlmO88700 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BlmO88700 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BlmO88700 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BlmO88700 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BlmO88700 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BlmO88700 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BlmO88700 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BlmO88700 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BlmO88700 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BlmO88700 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BlmO88700 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BlmO88700 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BlmO88700 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BlmO88700 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BlmO88700 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BlmO88700 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BlmO88700 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BlmO88700 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BlmO88700 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms