Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dnmt3aO88508 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnmt3aO88508 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms