Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CntfrO88507 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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