Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnt1O88346 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnt1O88346 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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