Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad51dO55230 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms