Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc3O55013 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms