Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NlkO54949 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NlkO54949 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NlkO54949 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NlkO54949 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NlkO54949 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms