Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TsksO54887 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TsksO54887 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TsksO54887 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TsksO54887 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TsksO54887 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TsksO54887 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TsksO54887 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TsksO54887 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TsksO54887 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TsksO54887 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TsksO54887 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TsksO54887 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TsksO54887 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TsksO54887 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TsksO54887 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TsksO54887 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TsksO54887 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TsksO54887 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TsksO54887 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TsksO54887 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TsksO54887 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TsksO54887 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TsksO54887 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TsksO54887 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms